

PFRMAT AL
TARGET T0128
AUTHOR 9885-9936-6780
METHOD Smith-Waterman alignment of secondary structure
METHOD and sequence
MODEL 2
PARENT 1b06_B
S   12   V    3
V   13   I    4
T   14   Q    5
T   15   L    6
K   16   K    7
R   17   R    8
Y   18   Y    9
T   19   E   10
L   20   F   11
P   21   P   12
P   22   Q   13
L   23   L   14
P   24   P   15
Y   25   Y   16
A   26   K   17
Y   27   V   18
N   28   D   19
A   29   A   20
L   30   L   21
E   31   E   22
P   32   P   23
Y   33   Y   24
I   34   I   25
S   35   S   26
A   36   K   27
E   37   D   28
I   38   I   29
M   39   I   30
Q   40   D   31
L   41   V   32
H   42   H   33
H   43   Y   34
Q   44   N   35
K   45   G   36
H   46   H   37
H   47   H   38
Q   48   K   39
G   49   G   40
Y   50   Y   41
V   51   V   42
N   52   N   43
G   53   G   44
A   54   A   45
N   55   N   46
A   56   S   47
A   57   L   48
L   58   L   49
E   59   D   50
K   60   R   51
L   61   L   52
E   62   E   53
K   63   K   54
F   64   L   55
R   65   I   56
K   66   K   57
G   67   G   58
E   68   Q   62
A   69   G   63
Q   70   Q   64
I   71   Y   65
D   72   D   66
I   73   L   67
R   74   Q   68
A   75   G   69
V   76   I   70
L   77   L   71
R   78   R   72
D   79   G   73
L   80   L   74
S   81   T   75
F   82   F   76
H   83   N   77
L   84   I   78
N   85   N   79
G   86   G   80
H   87   H   81
I   88   K   82
L   89   L   83
H   90   H   84
S   91   A   85
I   92   I   86
F   93   Y   87
W   94   W   88
P   95   N   89
N   96   N   90
M   97   M   91
A   98   A   92
P   99   P   93
P  100   A   94
G  101   G   95
K  102   K   96
G  103   G   97
G  104   G   98
G  105   G   99
K  106   K  100
P  107   P  101
G  108   G  102
G  109   G  103
K  110   A  104
I  111   L  105
A  112   A  106
D  113   D  107
L  114   L  108
I  115   I  109
N  116   D  110
K  117   K  111
F  118   Q  112
F  119   Y  113
G  120   G  114
S  121   S  115
F  122   F  116
E  123   D  117
K  124   R  118
F  125   F  119
K  126   K  120
E  127   Q  121
E  128   V  122
F  129   F  123
S  130   S  124
Q  131   E  125
A  132   S  126
A  133   A  127
K  134   N  128
N  135   S  129
V  136   L  130
E  137   P  131
G  138   G  132
V  139   S  133
G  140   G  134
W  141   W  135
A  142   T  136
I  143   V  137
L  144   L  138
V  145   Y  139
Y  146   Y  140
E  147   D  141
P  148   N  142
L  149   E  143
E  150   S  144
E  151   G  145
Q  152   N  146
L  153   L  147
L  154   Q  148
I  155   I  149
L  156   M  150
Q  157   T  151
I  158   V  152
E  159   E  153
K  160   N  154
H  161   H  155
N  162   F  156
L  163   M  157
M  164   N  158
H  165   H  159
A  166   I  160
A  167   A  161
D  168   E  162
A  169   L  163
Q  170   P  164
V  171   V  165
L  172   I  166
L  173   L  167
A  174   I  168
L  175   V  169
D  176   D  170
V  177   E  171
W  178   F  172
E  179   E  173
H  180   H  174
A  181   A  175
Y  182   Y  176
Y  183   Y  177
L  184   L  178
Q  185   Q  179
Y  186   Y  180
K  187   K  181
N  188   N  182
D  189   K  183
R  190   R  184
G  191   G  185
S  192   D  186
Y  193   Y  187
V  194   L  188
D  195   N  189
N  196   A  190
W  197   W  191
W  198   W  192
N  199   N  193
V  200   V  194
V  201   V  195
N  202   N  196
W  203   W  197
D  204   D  198
D  205   D  199
V  206   A  200
E  207   E  201
R  208   K  202
R  209   R  203
L  210   L  204
Q  211   Q  205
K  212   K  206
TER
END
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Ajay K. Royyuru, PhD                   Phone: (914) 945-1335
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