
PFRMAT AL
TARGET T0128
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  3
PARENT 1mng_A
R 17 P 3
Y 18 F 4
T 19 K 5
L 20 L 6
P 21 P 7
P 22 D 8
L 23 L 9
P 24 G 10
Y 25 Y 11
A 26 P 12
Y 27 Y 13
N 28 E 14
A 29 A 15
L 30 L 16
E 31 E 17
P 32 P 18
Y 33 H 19
I 34 I 20
S 35 D 21
A 36 A 22
E 37 K 23
I 38 T 24
M 39 M 25
Q 40 E 26
L 41 I 27
H 42 H 28
H 43 H 29
Q 44 Q 30
K 45 K 31
H 46 H 32
H 47 H 33
Q 48 G 34
G 49 A 35
Y 50 Y 36
V 51 V 37
N 52 T 38
G 53 N 39
A 54 L 40
N 55 N 41
A 56 A 42
A 57 A 43
L 58 L 44
E 59 E 45
K 60 K 46
L 61 Y 47
E 62 P 48
K 63 Y 49
F 64 L 50
R 65 H 51
K 66 G 52
G 67 V 53
E 68 E 54
A 69 V 55
Q 70 E 56
I 71 V 57
D 72 L 58
I 73 L 59
R 74 Q 67
A 75 D 68
V 76 I 69
L 77 Q 70
R 78 T 71
D 79 A 72
L 80 V 73
S 81 R 74
F 82 N 75
H 83 N 76
L 84 G 77
N 85 G 78
G 86 G 79
H 87 H 80
I 88 L 81
L 89 N 82
H 90 H 83
S 91 S 84
I 92 L 85
F 93 F 86
W 94 W 87
P 95 R 88
N 96 L 89
M 97 L 90
A 98 T 91
P 99 P 92
P 100 G 93
G 103 G 94
G 104 A 95
G 105 K 96
K 106 E 97
P 107 P 98
G 108 V 99
G 109 G 100
K 110 E 101
I 111 L 102
A 112 K 103
D 113 K 104
L 114 A 105
I 115 I 106
N 116 D 107
K 117 E 108
F 118 Q 109
F 119 F 110
G 120 G 111
S 121 G 112
F 122 F 113
E 123 Q 114
K 124 A 115
F 125 L 116
K 126 K 117
E 127 E 118
E 128 K 119
F 129 L 120
S 130 T 121
Q 131 Q 122
A 132 A 123
A 133 A 124
K 134 M 125
N 135 G 126
V 136 R 127
E 137 F 128
G 138 G 129
V 139 S 130
G 140 G 131
W 141 W 132
A 142 A 133
I 143 W 134
L 144 L 135
V 145 V 136
Y 146 K 137
E 147 D 138
P 148 P 139
L 149 F 140
E 151 G 141
Q 152 K 142
L 153 L 143
L 154 H 144
I 155 V 145
L 156 L 146
Q 157 S 147
I 158 T 148
E 159 P 149
K 160 N 150
H 161 Q 151
N 162 D 152
L 163 N 153
M 164 P 154
H 165 V 155
A 166 M 156
A 167 E 157
D 168 G 158
A 169 F 159
Q 170 T 160
V 171 P 161
L 172 I 162
L 173 V 163
A 174 G 164
L 175 I 165
D 176 D 166
V 177 V 167
W 178 W 168
E 179 E 169
H 180 H 170
A 181 A 171
Y 182 Y 172
Y 183 Y 173
L 184 L 174
Q 185 K 175
Y 186 Y 176
K 187 Q 177
N 188 N 178
D 189 R 179
R 190 R 180
G 191 A 181
S 192 D 182
Y 193 Y 183
V 194 L 184
D 195 Q 185
N 196 A 186
W 197 I 187
W 198 W 188
N 199 N 189
V 200 V 190
V 201 L 191
N 202 N 192
W 203 W 193
D 204 D 194
D 205 V 195
V 206 A 196
E 207 E 197
R 208 E 198
R 209 F 199
L 210 F 200
Q 211 K 201
K 212 K 202
A 213 A 203
TER
END

